La Junta Directiva es el órgano de gobierno, gestión y representación de la Asociación. Está integrada, siempre que sea posible, por los siguientes vocales, todos ellos con voz y voto:

• Sector público: 7 representantes de todos los Ayuntamientos asociados.
• Sector productivo: 4 representantes del sector productivo.
• Colectivos sociales: 4 de los colectivos sociales.

La Junta Directiva elige de entre sus miembros una Presidencia, una Secretaría y una Tesorería.